Filharmonie Brno pořádá ve svém sídelním městě ročně kolem 65 koncertů. Velké symfonické koncerty se konají v Janáčkově divadle. Komorněji laděný repertoár se uplatňuje v sídle Filharmonie Brno, v novorenesančním sále Besedního domu. Orchestr také vystupuje na historickém nádvoří brněnského hradu Špilberk, kde každoročně pořádá letní Mezinárodní hudební festival Špilberk. Od roku 2007 orchestr rovněž využívá strojírenskou halu přebudovanou v moderní obrazovou galerii Wannieck Gallery.
Ve své vlasti je Filharmonie Brno především pravidelným účastníkem význačných festivalů (Pražské jaro, Moravský podzim, Janáčkův máj, Smetanova Litomyšl, Dny Emy Destinnové). Orchestr také vystupuje na řadě zahraničních turné.
Filharmonie Brno se od počátku profilovala jako janáčkovský orchestr a přispěla tak výrazně k tomu, že se Brno, v němž Leoš Janáček vytvořil prakticky celé své dílo, stalo živým ohniskem jeho hudby. Od svého založení hraje filharmonie na domácích i zahraničních koncertech Janáčkovu hudbu prakticky pořád; natočila také, a to několikrát, jeho kompletní symfonickou a kantátovou tvorbu.